| 宝暦 |
6年 |
（1756年） |
肥後藩主細川重賢、医学寮を創設して再春館と称した |
| 明治 |
4年 |
（1871年） |
廃藩置県により官立医学所兼病院（通称古城医学校）と改称 |
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21年 |
（1888年） |
勅令により全国の県立医学校が廃止 |
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29年
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（1896年） |
県の補助を受け、私立熊本医学校を創設 |
大正
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11年 |
（1922年） |
熊本県立熊本医科大学となる |
| 昭和 |
4年 |
（1929年） |
官立熊本医科大学に移管される |
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14年 |
（1939年） |
附属医学専門部及び附属体質医学研究所を設置 |
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24年 |
（1949年） |
熊本大学医学部及び附属病院となる |
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30年 |
（1955年） |
熊本大学大学院医学研究科を設置 |
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41年 |
（1966年） |
附属中毒研究施設を設置 |
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48年 |
（1973年） |
附属免疫医学研究施設を設置 |
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51年 |
（1976年） |
肥後医育記念館寄贈される |
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56年 |
（1981年） |
附属動物実験施設を設置 |
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57年 |
（1982年） |
中毒研究施設と免疫研究施設を統合し免疫医学研究施設を改組 |
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59年 |
（1984年） |
体質医学研究所を廃止し、附属遺伝医学研究施設を設置 |
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63年 |
（1988年） |
福利施設楷樹会会館竣工 |
| 平成 |
4年 |
（1992年） |
免疫医学研施設及び遺伝医学研究施設を廃止し、遺伝発生医学研究施設及び大学院医学研究科脳・免疫統合科学系を設置 |
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9年 |
（1997年） |
熊本大学エイズ学研究センターを設置 |
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10年 |
（1998年） |
再開発により基礎医学研究棟竣工 |
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同 |
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附属動物実験施設を廃止し、熊本大学動物資源開発研究センターを設置 |
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12年 |
（2000年） |
附属遺伝医学研究施設を廃止し、熊本大学発生医学研究センターを設置 |
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14年 |
（2002年） |
医学研究科医科学専攻（修士課程）を設置 |
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同 |
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附属病院西病棟竣工 |
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15年 |
（2003年） |
共同実験棟竣工 |
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同 |
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動物資源開発研究センター、アイソトープ総合センター、RI研究施設、機器分析センターおよび遺伝子実験施設を統合して生命資源研究・支援センターを設置 |
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同 |
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大学院医学研究科を廃止し、熊本大学医学薬学研究部及び医学教育部を設置 |
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同 |
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医学部保健学科設置 |
